Modultitel

  • Bakterielle Genomforschung

Modultitel (Englisch)

Lehrveranstaltungen des Moduls

  • Genome Research (WS: 2V): 3 LP = 90h Arbeitsaufwand
  • Gene und Genome (SS: 2V): 3 LP = 90h Arbeitsaufwand
  • Praktikum Genomforschung (WS: 2Pr): 2 LP = 60h Arbeitsaufwand
  • Praktikum Bioinformatik (SS: 2Pr): 2 LP = 60h Arbeitsaufwand

Modulverantwortliche(r)

Lehrinhalte

In diesem Modul werden die theoretischen und praktischen Grundlagen der Genomforschung vertieft, wobei die bakterielle Genomforschung im Vordergrund steht. Aufbauend auf dem Modul Genomforschung I des Bachelorstudiengangs Bioinformatik und Genomforschung, in dem die Grundlagen der  Genomsequenzierung und -Annotation vermittelt wurden, werden die Methoden der Genomannotation weiter vertieft. Hierbei werden insbesondere Schwerpunkte auf die Identifizierung regulatorischer Sequenzen und auf Genomvergleiche gelegt. Des weiteren werden theoretische und praktische Kenntnisse der Postgenomforschung Transkriptomik, Proteomik und Metabolomik erarbeitet. Dabei werden auch die in den Biowissenschaften angewandten analytischen Methoden behandelt. Die Anwendung und das Verständnis verfügbarer Programme und Werkzeuge zur Datenauswertung und zur komparativen Genomik bilden einen weiteren Schwerpunkt des Moduls.

Literatur:
Bioanalytik, Friedrich Lottspeich,Haralabos Zorbas, Spektrum Akademischer Verlag.
Genomes 2, Terence A. Brown, BIOS Scientific Publishers.
Genome Mapping and Sequencing, Ian Dunham (ed.), Horizon Scientific Press, 15.07.2003.
Microbial Genomes, Claire M. Fraser, Timothy Ready, Karen E. Nelson, Humana Pr, 01.09.2003.

Kompetenzen

Die Studierenden sollen ein Verständnis für die in der bakteriellen Genomforschung angewandten Strategien erlangen. Neben theoretischen Kenntnissen sollen vor allem auch praktische Kenntnisse in aktuellen Methoden der Genomforschung vermittelt werden. Praktische Kenntnisse sollen sowohl im Labor bei der Erzeugung von Daten als auch bei der computer-gestützten Auswertung erlernt werden.

Anzahl Einzelleistungen (benotet und unbenotet)

eine benotete und zwei unbenotete Einzelleistungen

Prüfungsformen

benotete schriftliche Prüfung über Inhalte der Vorlesungen, unbenotete Praktikumsberichte, Seminarvorträge

Voraussetzungen für die Vergabe von Leistungspunkten

Bestehen der Klausur und Vorlage von Praktikumberichten, Vortrag im Seminar

Arbeitsaufwand und Leistungspunkte

Genome Research (WS: 2V): 3 LP
Gene und Genome (SS: 2V): 3 LP
Praktikum Genomforschung (WS: 2Pr): 2 LP
Praktikum Bioinformatik (SS: 2Pr): 2 LP
= 90h Arbeitsaufwand
= 90h Arbeitsaufwand
= 60h Arbeitsaufwand
= 60h Arbeitsaufwand

Leistungspunkte für das Modul: 10 LP

Teilnahmevoraussetzungen und Vorkenntnisse

keine

Modultyp und Verwendbarkeit

Wahlpflichtmodul in den Masterstudiengängen

  • Bioinformatik und Genomforschung (WP Genomforschung)
  • Naturwissenschaftliche Informatik (Vertiefung Naturwissenschaften)

Dauer des Moduls / Angebotsturnus

Beginn: Wintersemester, Turnus: jährlich