Modultitel

  • Algorithmen in der Genomforschung

Modultitel (Englisch)

  • Algorithms in Genome Research

Lehrveranstaltungen des Moduls

  • Algorithmen in der Genomforschung (Vorlesung und Übungen)
  • Bioinformatische Anwendungen in der Genomforschung (Praktikum)

Lehrinhalte

In diesem Modul werden verschiedene bioinformatische Techniken in der Genomforschung behandelt. Hierunter fallen Algorithmen zur Genomkartierung und -assemblierung, Methoden zur funktionellen Genomannotation, insbesondere Genvorhersage und -funktionsbestimmung, Verfahren zur Analyse von DNA-Microarrays und Massenspektren, Methoden und Modelle zur Proteinstrukturvorhersage sowie Algorithmen zum Vergleich zweier oder mehrerer Genome.

Kompetenzen

Die Studierenden sollen aktuelle bioinformatische Methoden der Genomforschung kennenlernen und praktische Erfahrung mit diesen sammeln. Dies umfasst sowohl die zugrundeliegenden mathematischen und algorithmischen Techniken als auch die Kenntnis geeigneter Softwarewerkzeuge, die diese Techniken implementieren. Im Praktikum sollen auch kleinere Eigenentwicklungen erstellt und an realen Daten getestet werden.

Anzahl Einzelleistungen (benotet und unbenotet)

eine benotete und eine unbenotete Einzelleistung

Prüfungsformen

  • benotete mündliche Prüfung über die Inhalte der Vorlesung
  • selbstständige Bearbeitung von Praktikumsaufgaben

Voraussetzungen für die Vergabe von Leistungspunkten

Bestehen der mündlichen Prüfung ergibt 5 LP
Erfolgreiche Bearbeitung der Praktikumsaufgaben ergibt 5 LP

Arbeitsaufwand und Leistungspunkte

Algorithmen in der Genomforschung:
Vorlesung
Nachbereitung der Vorlesung
Übungen
Vorbereitung der Übungen
Vorbereitung auf die mündliche Prüfung
gesamt: 150h = 5 LP

 

2 SWS x 16 Wochen
1h/Woche x 16 Wochen
2 SWS x 16 Wochen
1h/Woche x 16 Wochen

 

= 30h
= 15h
= 30h
= 15h
= 60h

Bioinformatische Anwendungen
in der Genomforschung (Block,
4 Wochen x 4 Tage):
Praktikum (Block)
Vorbereitung des Praktikums
Nachbereitung des Praktikums
gesamt: 150h = 5 LP



16 Tage x 7h
16 Tage x 0,5h
16 Tage x 1,5h



= 110h
= 10h
= 30h

Leistungspunkte für das Modul: 10 LP

Teilnahmevoraussetzungen und Vorkenntnisse

Empfohlen: Grundkenntnisse in Algorithmen und Datenstrukturen, Sequenzanalyse und Genomforschung

Modultyp und Verwendbarkeit

Wahlpflichtmodul für die Masterstudiengänge

  • Bioinformatik und Genomforschung (WP Bioinformatik), 1. + 2. Semester
  • Naturwissenschaftliche Informatik (Vertiefung Informatik), 1. + 2. Semester
  • Molekulare Biotechnologie (Spezialisierung Biologie/Bioinformatik/Genomforschung), 1. + 2. Semester

Das Praktikum "Bioinformatische Anwendungen in der Genomforschung" ist auch Bestandteil des Moduls "Angewandte Bioinformatik". Aus diesem Grund kann nur eins der beiden Module angerechnet werden.

Dauer des Moduls / Angebotsturnus

Wintersemester: Algorithmen in der Genomforschung
Sommersemester: Bioinformatische Anwendungen in der Genomforschung
jährlich