Modultitel

  • Sequenzanalyse

Modultitel (Englisch)

  • Sequence Analysis

Lehrveranstaltungen des Moduls

  • Sequenzanalyse I (Vorlesung und Übungen)
  • Sequenzanalyse II (Vorlesung)
  • Sequenzanalyse-Praktikum (Übung)

Lehrinhalte

In diesem Modul werden die gängigen Techniken der Sequenzanalyse behandelt: Exakte und approximative Textsuche, paarweises und multiples Alignment, Datenstrukturen zur Indizierung von Texten, Werkzeuge zur schnellen Sequenzdatenbanksuche.

Kompetenzen

Den Studierenden werden die theoretischen Grundlagen der Sequenzanalyse vermittelt, sie lernen die gängigen Werkzeuge kennen und sammeln praktische Erfahrung mit diesen Werkzeugen.

Anzahl Einzelleistungen (benotet und unbenotet)

zwei benotete und eine unbenotete Einzelleistung

Prüfungsformen

  • Portfolio bestehend aus Übungsaufgaben und benoteter Klausur oder benoteter mündlicher Prüfung zu "Sequenzanalyse I". Erfolgreiches Lösen der Übungsaufgaben (Bestehensgrenze 50%) ist Voraussetzung für die Teilnahme an der Abschlussklausur oder der abschließenden mündlichen Prüfung. Die Übungsaufgaben werden in der Regel wöchentlich ausgegeben. Die benotete Abschlussklausur oder abschließende benotete mündliche Prüfung beziehen sich auf den Stoff der Vorlesung und der Übungen.
  • Benotete Klausur oder benotete mündliche Prüfung zu "Sequenzanalyse II".
  • Anfertigen eines Praktikumsberichts einschließlich eines Vortrags zu einem Thema des "Sequenzanalyse-Praktikums".

Voraussetzungen für die Vergabe von Leistungspunkten

Bestehen des Portofolios zu "Sequenzanalyse I" ergibt 5 LP. Bestehen der Klausur oder der mündlichen Prüfung zu "Sequenzanalyse II" ergibt 3 LP. Erstellen des Praktikumsberichts zum "Sequenzanalyse-Praktikum" ergibt 2 LP.

Arbeitsaufwand und Leistungspunkte

Sequenzanalyse I:
Vorlesung
Nachbereitung der Vorlesung
Übungen
Vorbereitung der Übungen
Vorbereitung auf die Klausur
gesamt: 150h = 5 LP		 2 SWS x 16 Wochen
1h/Woche x 16 Wochen
2 SWS x 16 Wochen
2h/Woche x 16 Wochen

 = 30h
= 15h
= 30h
= 30h
= 45h
Sequenzanalyse II:
Vorlesung
Nachbereitung der Vorlesung
Vorbereitung auf die Klausur
gesamt: 90h = 3 LP		 2 SWS x 16 Wochen
1h/Woche x 16 Wochen

 = 30h
= 15h
= 45h
Sequenzanalyse-Praktikum:
Praktikum
Nachbereitung des Praktikums
gesamt: 60h = 2 LP		 2 SWS x 16 Wochen
2h/Woche x 16 Wochen		 = 30h
= 30h

Leistungspunkte für das Modul: 10 LP

Teilnahmevoraussetzungen und Vorkenntnisse

Algorithmen und Datenstrukturen oder Grundlagen der Programmierung

Modultyp und Verwendbarkeit

Pflichtmodul für den Bachelorstudiengang

  • Bioinformatik und Genomforschung, 3. + 4. Semester

Wahlpflichtmodul für die Bachelorstudiengänge

  • Naturwissenschaftliche Informatik (WP Vertiefung Informatik), 5. + 6. Semester
  • Nebenfach Informatik (WP Vertiefung Informatik), 5. + 6. Semester

Wahlpflichtmodul für den Masterstudiengang

  • Naturwissenschaftliche Informatik (Grundlagen Ergänzung), 1. + 2. Semester

Dauer des Moduls / Angebotsturnus

Wintersemester: Sequenzanalyse I
Sommersemester: Sequenzanalyse II
Sommersemester: Sequenzanalyse-Praktikum
jährlich