Modultitel

  • Spezielle Algorithmen der Bioinformatik

Modultitel (Englisch)

  • Special Algorithms in Bioinformatics

Lehrveranstaltungen des Moduls

  • Hauptseminar Algorithmen in der Bioinformatik (Seminar)
  • Spezielle Algorithmen der Bioinformatik (Vorlesung und Übungen)

Lehrinhalte

In diesem Modul werden grundlegende Algorithmen der Bioinformatik behandelt, die nicht in das Gebiet der Sequenzanalyse fallen. Hierzu gehören beispielsweise Verfahren zur Rekonstruktion phylogenetischer Bäume, kombinatorische Algorithmen in der Genomik und Proteomik, Methoden zur Proteinstrukturvorhersage und zur Modellierung zellulärer Interaktions- und Regulationskreisläufe.

Kompetenzen

Den Studierenden werden die verschiedenen bioinformatischen Fragestellungen und Lösungsansätze vermittelt. Im Hauptseminar sollen der Umgang mit Originalliteratur, Präsentationstechniken und die Anfertigung einer schriftlichen Ausarbeitung geübt werden.

Anzahl Einzelleistungen (benotet und unbenotet)

eine unbenotete und zwei benotete Einzelleistungen

Prüfungsformen

  • unbenoteter Vortrag im Hauptseminar,
  • benotete Ausarbeitung im Hauptseminar,
  • Portfolio bestehend aus Übungsaufgaben und benoteter Klausur oder benoteter mündlicher Prüfung zu "Spezielle Algorithmen der Bioinformatik". Erfolgreiches Lösen der Übungsaufgaben (Bestehensgrenze 50%) ist Voraussetzung für die Teilnahme an der  Abschlussklausur oder der abschließenden mündlichen Prüfung. Die Prüfungsaufgaben werden in der Regel wöchentlich ausgegeben. Abschlussklausur oder abschließende mündliche Prüfung beziehen sich auf den Stoff der Vorlesung und der Übungen.

Voraussetzungen für die Vergabe von Leistungspunkten

Vortrag im Hauptseminar ergibt 2 LP, Ausarbeitung im Hauptseminar ergibt 2 LP, Bestehen des Portofolios zu "Spezielle Algorithmen der Bioinformatik" ergibt 4 LP.

Arbeitsaufwand und Leistungspunkte

Hauptseminar Algorithmen
in der Bioinformatik:
Seminar
Vorbereitung des Vortrags
Erstellen der Ausarbeitung
gesamt: 120h = 4 LP		 2 SWS x 16 Wochen
= 30h
= 45h
= 45h
Spezielle Algorithmen in
der Bioinformatik:
Vorlesung
Nachbereitung der Vorlesung
Übungen
Vorbereitung der Übungen
Vorbereitung auf die Klausur
gesamt: 120h = 4 LP
2 SWS x 16 Wochen
1h/Woche x 16 Wochen
2 SWS x 16 Wochen
1h/Woche x 16 Wochen
= 30h
= 15h
= 30h
= 15h
= 30h

Leistungspunkte für das Modul: 8 LP

Teilnahmevoraussetzungen und Vorkenntnisse

Voraussetzung: Algorithmen und Datenstrukturen
Empfohlen: Sequenzanalyse

Modultyp und Verwendbarkeit

Pflichtmodul für den Bachelorstudiengang

  • Bioinformatik und Genomforschung, 4. + 5. Semester

Dauer des Moduls / Angebotsturnus

Sommersemester: Hauptseminar Algorithmen in der Bioinformatik
Wintersemester: Spezielle Algorithmen der Bioinformatik
jährlich