Modultitel

  • Spezielle Algorithmen der Bioinformatik für Nebenfach

Modultitel (Englisch)

  • Special Algorithms in Bioinformatics for a Minor Subject

Lehrveranstaltungen des Moduls

  • Spezielle Algorithmen der Bioinformatik (Vorlesung und Übungen)
  • Algorithmische Implementierung (Übung)

Lehrinhalte

In diesem Modul werden grundlegende Algorithmen der Bioinformatik behandelt, die nicht in das Gebiet der Sequenzanalyse fallen. Hierzu gehören beispielsweise Verfahren zur Rekonstruktion phylogenetischer Bäume, kombinatorische Algorithmen in der Genomik und Proteomik, Methoden zur Proteinstrukturvorhersage und zur Modellierung zellulärer Interaktions- und Regulationskreisläufe.

Kompetenzen

Den Studierenden werden die verschiedenen bioinformatischen Fragestellungen und Lösungsansätze vermittelt. In der Veranstaltung „Algorithmische Implementierung“ soll einer der untersuchten Algorithmen selbst implementiert werden.

Anzahl Einzelleistungen (benotet und unbenotet)

eine benotete und eine unbenotete Einzelleistung

Prüfungsformen

  • Portfolio bestehend aus Übungsaufgaben und benoteter Klausur oder benoteter mündlicher Prüfung zu "Spezielle Algorithmen der Bioinformatik". Erfolgreiches Lösen der Übungsaufgaben (Bestehensgrenze 50%) ist Voraussetzung für die Teilnahme an der Abschlussklausur oder der abschließenden mündlichen Prüfung. Die Prüfungsaufgaben werden in der Regel wöchentlich ausgegeben. Abschlussklausur oder abschließende mündliche Prüfung beziehen sich auf den Stoff der Vorlesung und der Übungen.
  • unbenotete Implementierungsaufgabe in der Übung

Voraussetzungen für die Vergabe von Leistungspunkten

Bestehen des Portofolios zu "Spezielle Algorithmen der Bioinformatik" ergibt 4 LP, erfolgreiches Bearbeiten der Implementierungsaufgabe ergibt 1 LP.

Arbeitsaufwand und Leistungspunkte

Spezielle Algorithmen in
der Bioinformatik:
Vorlesung
Nachbereitung der Vorlesung
Übungen
Vorbereitung der Übungen
Vorbereitung auf die Klausur
gesamt: 120h = 4 LP

 2 SWS x 16 Wochen
1h/Woche x 16 Wochen
2 SWS x 16 Wochen
1h/Woche x 16 Wochen

 = 30h
= 15h
= 30h
= 15h
= 30h
Algorithmische Implementierung:
Implementierung
gesamt: 30h = 1 LP		 = 30h

Leistungspunkte für das Modul: 5 LP

Teilnahmevoraussetzungen und Vorkenntnisse

Voraussetzung: Algorithmen und Datenstrukturen oder Grundlagen der Programmierung
Empfohlen: Sequenzanalyse

Modultyp und Verwendbarkeit

Wahlpflichtmodul für die Bachelorstudiengänge

  • Naturwissenschaftliche Informatik (WP Vertiefung Informatik), 5. + 6. Semester
  • Nebenfach Informatik (WP Vertiefung Informatik), 5. + 6. Semester

Wahlpflichtmodul für den Masterstudiengang

  • Naturwissenschaftliche Informatik (Grundlagen Ergänzung), 1. + 2. Semester

Dauer des Moduls / Angebotsturnus

Wintersemester: Spezielle Algorithmen der Bioinformatik
Sommersemester: Algorithmische Implementierung,
jährlich