Modultitel

  • Vertiefung Sequenzanalyse

Modultitel (Englisch)

  • Advanced Topics in Sequence Analysis

Lehrveranstaltungen des Moduls

  • Advanced Dynamic Programming (Vorlesung und Übungen)
  • RNA Strukturvorhersage und -vergleich (Vorlesung)
  • Erkennung regulativer Motive (Übungen)

Modulverantwortliche(r)

Lehrinhalte

In diesem Modul werden fortgeschrittene Techniken der Sequenzanalyse behandelt. Schwerpunkt auf der methodischen Seite ist die Algebraische Dynamische Programmierung, deren Einsatzbereich sehr weite Gebiete der Sequenzanalyse umfasst. Schwerpunkt der Anwendungen sind Algorithmen und Werkzeuge zur Untersuchung von RNA und ihren Funktionen, insbesondere in der Regulation.

Kompetenzen

Die Studierenden sollen aktuell eingesetzte Algorithmen und Werkzeuge kennenlernen und in die Lage versetzt werden, selbst zur Weiterentwicklung des aktuellen Standes der Forschung beizutragen. Im Praktikum ist entweder eine biologisch motivierte Anwendungsstudie unter Einsatz aktueller Werkzeuge vorgesehen, oder die (Weiter-)Entwicklung eines solchen Werkzeugs.

Anzahl Einzelleistungen (benotet und unbenotet)

eine benotete und eine unbenotete Einzelleistung

Prüfungsformen

eine benotete Klausur (RNA Strukturvorhersage und -vergleich)
eine unbenotete Klausur (Advanced Dynamic Programming)
Teilnahme an den Übungen

Voraussetzungen für die Vergabe von Leistungspunkten

Bestehen der Klausuren, aktive Teilnahme an den Übungen

Arbeitsaufwand und Leistungspunkte

Advanced Dynamic Programming:
Vorlesung
Nachbereitung der Vorlesung
Übungen
Vorbereitung der Übungen
Vorbereitung der Klausur
gesamt: 159h = 5 LP		 2 SWS x 16 Wochen
3h/Woche x 16 Wochen
2 SWS x 16 Wochen
2h/Woche x 16 Wochen
 = 32h
= 48h
= 32h
= 32h
= 15h
RNA Strukturvorhersage und
-vergleich:
Vorlesung
Nachbereitung der Vorlesung
Vorbereitung der Klausur
gesamt: 95h = 3 LP		 2 SWS x 16 Wochen
3h/Woche x 16 Wochen
= 32h
= 48h
= 15h
Erkennung regulativer Motive:
Übungen
Bearbeitung der Übungsaufgaben
gesamt: 56h = 2 LP		 2 SWS x 16 Wochen
1,5 x 16h		 = 32h
= 24h

Leistungspunkte für das Modul: 10 LP

Teilnahmevoraussetzungen und Vorkenntnisse

Modul Sequenzanalyse

Modultyp und Verwendbarkeit

Wahlpflichtmodul für die Masterstudiengänge

  • Naturwissenschaftliche Informatik (Vertiefung Informatik)
  • Bioinformatik und Genomforschung (WP Bioinformatik)

Dauer des Moduls / Angebotsturnus

Wintersemester: Advanced Dynamic Programming
Sommersemester: RNA Strukturvorhersage und -vergleich, Erkennung regulativer Motive
jährlich