Modultitel

Interdisziplinäre ZellVisualisierung

Modultitel (Englisch)

Interdisciplinary Cell Visualization

Lehrveranstaltungen des Moduls

  • Vorlesung Interdisziplinäre Zellvisualisierung” (V, 2 SWS)
  • Seminar “Cell Visualization” (S, 2 SWS)
  • Projekt “CELLmicrocosmos Cell Modelling” (Pr, 4 SWS)

Modulverantwortliche(r)

Björn Sommer
Prof. Dr. Ralf Hofestädt

Lehrinhalte

Die Komplexität der biologischen Zelle macht sie zu einem adäquaten Paradigma für den visuellen Information Overloaddes Informationszeitalters. Die strukturellen, biologischen, chemischen und physikalischen Aspekte der Zelle übersteigen bereits jetzt den Horizont nicht nur eines jeden Laien sondern auch eines jeden Wissenschaftlers. Und das, obwohl es sich bei der Zelle um den kleinsten Baustein des Lebens handelt. Ohne eine gleichzeitig interdisziplinäre und reduzierende Herangehensweise ist die Bewältigung dieses Themas nicht möglich. Das heutige Überangebot und die Dominanz der zwei-dimensionaler Visualisierungsansätze steht im Kontrast zur drei-dimensionalen Realität der Zelle. Insbesondere die Kommerzialisierung der 3D-Stereoskopie bietet weitreichende Chancen, zukünftig multidimensionale und multimediale Konstrukte nicht nur visualisierbar sondern auch erfahrbar zu machen.
Dieses Modul beschäftigt sich nun mit der Frage, wie die Komplexität zellulärer Prozesse reduziert und dabei gleichzeitig die drei-dimensionale Räumlichkeit adäquat beibehalten werden kann. In der Vorlesung werden die unterschiedlichsten Visualisierungsansätze besprochen und analysiert. Gleichzeitig wird Basiswissen im Bereich der Zellbiologie vermittelt werden. Das Spektrum reicht von Filmsequenzen über Buch-Illustrationen, Webseiten, Datenbanken, Computerspielen und -programmen. In Relation dazu werden zelluläre Simulationsansätze, wissenschaftliche Publikationen und die durch die Mikroskopie generierte Realität gesetzt.
Die Vorlesung wird von einem Seminar begleitet, welches sich in diesem Spannungsfeld bewegen wird und gleichzeitig den Bezug zur Praxis herstellen wird. Das CELLmicrocosmos-Projekt ist im Bereich Zell- und Membran-Visualisierung angesiedelt und kann wahlweise Aufgaben aus der Programmierpraxis, der dreidimensionalen Modellierung oder Animation beinhalten.

Kompetenzen

Im Rahmen dieses Moduls können Teilnehmer erarbeiten, wie Zusammenhänge auf verschiedenen Komplexitätsebenen am Beispiel der Zellbiologie visuell reduziert und präzisiert werden können. Die Vorlesung wird Kompetenzen im Bereich der interdisziplinären Medienanalyse vermitteln. Während des praktischen Projektes können Kenntnisse im Bereich der dreidimensionalen Modellierung und Animation, Java/Java3D-Programmierung, 3D-Stereoskopie und/oder HTML-Kenntnisse vertieft werden.
Auf Grund des interdisziplinären Charakters ist zellbiologisches Vorwissen sowie Programmierpraxis keine Teilnahme-Voraussetzung.

Anzahl Einzelleistungen (benotet und unbenotet)

eine benotete Einzelleistung: Klausur oder mündliche Prüfung zur Vorlesung
zwei unbenotete Einzelleistungen: Seminarreferat und Absolvierung des Projektes.

Prüfungsformen

Die Modulnote wird über eine Klausur oder die mündliche Prüfung ermittelt. Voraussetzungen der Prüfung ist die erfolgreiche Teilnahme an der Vorlesung und dem Projektseminar.

Arbeitsaufwand und Leistungspunkte

Titel
Art Turnus Workload LP
Cell Visualization Seminar SS 30+30 2
Interdisziplinäre ZellVisualisierung Vorlesung SS 30+60 3
CELLmicrocosmos Cell Modelling Projekt WS+SS 30+120 5

 

Studienleistungen

 

Veranstaltung Workload LP
Cell Visualization (Seminar)Referat (25 min.) mit Ausarbeitung (5 Seiten) s.o. s.o.
CELLmicrocosmos Cell Modelling (Projekt) Projektarbeit (Programmierung oder Modellierung) mit anschließender Präsentation (ca. 15 min.) s.o. s.o.

 

Modulprüfung

 

Zuordnung
Art Gewicht Workload LP
Interdisziplinäre ZellVisualisierung (Vorlesung) Klausur oder mdl. Prüfung

 

 1 - -
Die Klausur (60-90 min.) oder die mündliche Prüfung (15-25 in.) bezieht sich auf den Stoff der Vorlesung.

Modultyp und Verwendbarkeit

Wahlpflichtmodul für Masterstudiengänge
  • Naturwissenschaftliche Informatik (Vertiefung Informatik; Wahlpflicht)
  • Bioinformatik und Genomforschung (Individuelle Ergänzung; Wahlpflicht)
  • Molekulare Biotechnologie (Spezialisierung Biologie/Bioinformatik/Genomforschung; Wahlpflicht)
  • Medienwissenschaften (Hauptmodul 4)
Wahlpflichtmodul für Bachelorstudiengänge
  • Medieninformatik und Gestaltung (Medieninformatik; Wahlpflicht)

Dauer des Moduls / Angebotsturnus

Sommersemester: Vorlesung und Seminar, optional Projekt Wintersemester: Projekt jährlich